押解着通缉犯霸王龙的巨无霸飞船在通过扭曲穿梭器制造虫洞返回塞伯坦的途中发生了重大错误，致使霸王龙先于巨无霸回到了塞伯坦，并控制了整颗塞伯坦星球。
猩猩队长和仅存的巨无霸终于返回了塞伯坦，冥冥之中领导模块指引他们重新得到了野兽变形形态，并意外发现了塞伯坦存在有机生命形式的证据。通过魔力神球和存在于其中的元始天尊的意识——圣贤，巨无霸了解到了整个塞伯坦的过去，现在和可能存在的未来。霸王龙通过火种分离技术分离摆脱自身有机形态的束缚，妄图完全消灭塞伯坦的有机生命形式。而这段无机生命形式与有机生命形式相抗争的时代，被后世称为野兽机器（BM时代）时代。
火种在世间不仅会受到圣贤的指引也会受到邪恶的诱惑，有些火种经受不住贪婪、懒惰、仇恨、妒忌等负面因素的诱惑最终堕落。邪恶本身并不强大，而是通过控制欲望和负面的思想来表现自己，强大自己。拒绝诱惑才可以获得真正意义上的强大，拥有真正的力量，战胜表面强大的邪恶。
霸王龙对虏获来的巨无霸犀牛勇士和闪电勇士的火种进行抽取并重新格式化，得到了新部下坦克战车和利剑飞船，并通过克隆技术制造了大量的无机生命形式部队，原始兽和巨无霸的实力产生了巨大的反差。最终，利剑飞船最终找回了格式化前的记忆，回归了代表有极生命形式的巨无霸，而坦克战车没有经受住科技的强大的与野心的诱惑，最终成为了悲剧，直到火种回到领导模块中才幡然领悟。
猩猩队长最终悟出了为什么几百万地球年来汽车人与霸天虎以及其后裔都无法消灭彼此的根本原因——因为魔力神球和圣贤意识到只有双方的同时存在，彼此平衡，互相制约，才能促使塞伯坦文明更好的向前发展。引用到塞伯坦有机生命形式与无机生命形式间的战争这一点也同样适合。塞伯坦不应该只是死气沉沉的机械星球，而更应该是有机生命形式和无机生命形式和谐共处的乐园。
猩猩队长孤军奋战，被迫与吸收了所有巨无霸火种，控制了整个塞伯坦的霸王龙展开最后的决战，并最终悲壮的选择了与霸王龙同归于尽。他们的身躯一起消失在了巨大的爆炸种种，火种则溶入了领导模块——其他塞伯坦人的火种被释放了，除了猩猩队长和霸王龙之外的塞伯坦人都复活了。塞伯坦内部处于被压制地位的绿色植物则源源不断的旺盛生长，最终使塞伯坦成为了有机生命形式和无机生命形式和谐共处的世界。而塞伯坦的黄金时代也再度降临……
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