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MSZ-006 Zeta高达WAVESHOOTER形态，以希腊字母“ζ”命名，这个形态的Zeta在动画中并没有出现，其造型来源应该是1990年老版HG的可变形Zeta模型，这个时期诞生出了High Grade级别的模型，纪念高达模型10周年。所谓的WAVESHOOTER，是为了在HG模型上达成可变形而做的妥协，原版Zeta的背包变形成WAVERIDER机翼翻转到机身下方是很复杂的结构，而WAVESHOOTER则是将机翼置于机身两侧，结构就相对简单。无论是MS形态，还是WAVESHOOTER形态，背包机翼的处理很像Delta。盾牌也与原版有所区别，大块面的黑色成为主色调，与原版相比更加厚重更加宽大。
武装与原版Zeta相同，只是原版Zeta盾牌中的小型榴弹发射仓在这台无法安装：
头部火神炮、腕部二连装榴弹发射器、光束军刀、光束步枪、高能MEGA粒子炮、专用盾牌。
之所以买这台W.S.形态的Zeta，一是好奇，二是被盾牌吸引，当时和伊芙利特改一起入手。这台基于新生Zeta做了部分板件调整，剩余零件很少，看来万代在流道开关上已有所计划。变更基本在背包和盾牌，以及比原版大很多的变形替换件。
基于新生Zeta，所以一些小毛病也一起继承：作为GEP企划第一弹，关节可动进行大量新设计，但部分关节略松，如脚踝球关节，肘部关节时间久了也会有松动的情况出现；头部转动会与领口干涉严重。除新生Zeta本来的问题之外就是大量补色贴纸，翅膀上的红色补色贴纸巨大且难贴；盾牌上的红色喷射口零件过松；替换变形时相较原版Zeta需要增加取出前裙甲零件的步骤，而固定前裙甲零件的卡隼在多次拆组后必定会有损耗。不过喜欢Zeta，这些都可以包容。
盾牌黑色面积增大，也比W.R.体积大很多
光束军刀特效件可以搭载在光束步枪或者MEGA粒子炮炮口作为光束军刀或者光束特效，可惜没有开掌造型手······
新生相较于旧版，肩部增加引出关节和上抬关节，双手握持MEGA粒子炮更自然
与旧版Zeta一样，新生无法收纳光束军刀剑柄，进行小改造在侧裙甲内部和剑柄上加一个卡隼卡槽结构就可以
新生的腕部榴弹发射器终于可以翻开了
WAVESHOOTER形态，替换变形（吐槽下新生，旧版Zeta膝盖后方动力管零件是可以滑动的，变形时能实现简单联动，新生却直接成了插拔）
相较于W.R.形态，W.S.形态将机翼置于机身两边（侧裙甲和腿部位置），翼展更大，底部盾牌的大块黑色也很瞩目，但机体底部包覆度不如W.R.，额外拆下的前裙甲也暴露在外
一样可以通过搭载MEGA粒子炮及起落架替换件实现桌面停驻
变形后剩余的主体替换件，比旧版Zeta拆的更彻底，不过手臂终于参与替换变形
全部配件
与HGUC041号旧版Zeta高达对比（左旧右新）
两种不同变形形态对比（左旧右新）
起落架变化不大（左新右旧）
